LAMMC Žemdirbystės instituto Mikrobiologijos laboratorijos doktorantė Egidija Satkevičiūtė penkias savaites nuo birželio 1 iki liepos 5 d. stažavosi Danijoje, Kopenhagos universiteto Augalų ir aplinkos mokslų departamento Mikrobinių sąveikų tyrimų grupėje. Stažuotės tema – „Shotgun metagenominių duomenų analizė kviečių rizosferos mikrobiomui: kontrolės ir sausros sąlygų diferencialinė analizė“, tikslas – įvertinti sausros poveikį mikrobiomo funkciniam potencialui ir identifikuoti perspektyvius funkcinius žymenis tolesniems tyrimams.
Stažuotės metu buvo kuriama ir tobulinama ištisinė (angl. shotgun) metagenominių duomenų analizė, leidžianti tirti, kaip sausra keičia žieminių kviečių rizosferos mikrobiomo funkcinį potencialą. Taip pat atlikta funkcinė ir statistinė metagenominių duomenų analizė, kurios rezultatai taps pagrindu būsimai mokslinei publikacijai ir tolesniam Lietuvos bei Danijos mokslininkų bendradarbiavimui.
Gauti pirminiai rezultatai atskleidė reikšmingus funkcinių kategorijų, metabolinių kelių ir augalų augimą skatinančių funkcijų pokyčius tarp kontrolės bei sausros sąlygų ir sudarė pagrindą tolesnei rezultatų biologinei interpretacijai.
Stažuotės metu įgytos pažangios Linux operacinės sistemos, bioinformatikos ir statistinės analizės kompetencijos, sukurta bioinformatinės analizės eiga. Gauti rezultatai padėjo pagrindą būsimos mokslinės publikacijos rengimui ir tolesniam šio tyrimo vystymui.
Stažuotė suteikė galimybę įgyti naujų bioinformatikos kompetencijų, dirbti tarptautinėje mokslinėje komandoje ir prisidėti prie pažangių augalų mikrobiomo tyrimų.
